真菌以几丁质为细胞壁骨架、以麦角固醇为膜主要甾醇。临床重要种类包括白色念珠菌、新型隐球菌和烟曲霉。抗真菌靶点包括CYP51/ERG11(唑类)、β-1,3-葡聚糖合酶(棘白菌素类如卡泊芬净)和鞘脂合成。耐唑类念珠菌(如耳念珠菌)构成新兴公共卫生威胁。