ATG（autophagy-related）蛋白是自噬分子机器的核心组分。ULK1/2复合物（ATG1同源物）启动自噬，VPS34/Beclin 1 PI3K-III复合物驱动隔离膜核化，ATG12-ATG5-ATG16L1和ATG8/LC3-PE两个泛素样结合系统促进膜延伸和闭合。ATG蛋白的缺失突变可导致自噬缺陷，与神经退行性疾病和肿瘤发生相关。
